'SOD1 gene분석과 단백질 3차구조 모델링(3D modeling) ' 실험레포트

소개글

SOD1 gene을 분석하고 NCBI, BLAST 등의 툴을 이용하여 SOD1 protein의 3차구조를 모델링하는 과정을 작성하였습니다.
레포트 점수 만점받은 자료입니다
레포트 쓰실 때 도움 되실거에요 :)

목차

1. Introduction
1) NCBI를 통해 사용할 수 있는 데이터베이스
2) Gene Mutation
3) SOD1 gene

2. Method

3. Result
1) NCBI
2) Sequence Alignment
3) Protein 3D Modeling

4. Discussion

5. Reference

본문내용

[1] Introduction
{1} NCBI를 통해 사용할 수 있는 데이터베이스
:NCBI(National Center for Biotechnology Information)에서는 여기저기 산재되어 있는 다양한 database를 한 곳에서 모아 볼 수 있는데 이번 레포트에서는 NCBI에 존재하는 datebase 중 3가지를 간략히 소개하겠다.
-Pubmed :생명과학 관련 다양한 논문 data 제공
-SRA: Short Read Archive의 약자로 1,000개 미만의 짧은 가닥의 DNA sequencing에 대한 data를 제공
-dbVar : genomic variant에 대한 정보를 제공.

{2} Gene Mutation
DNA복제의 실수, 이성질화 반응, 탈퓨린 반응, 화학적 돌연변이 유발원 등의 다양한 이유로 유전자의 돌연변이가 일어날 수 있으며 돌연변이는 크게 아래 세종류로 나눌 수 있다.
(1) 염기 돌연변이( Coding region mutation)
-치환 돌연변이 : 원래 염기가 다른 염기로 바뀌는 현상으로 purine끼리, pyrimidine끼리 바뀌는 경우를 Transition, purine이 pyrimidine으로 혹은 그 반대로 바뀌는 경우를 Transversion이라고 한다. 다음과 같은 4가지 경우로 나누어진다.

참고 자료

박선우. BIOLOGY 2nd, 좋은 친구들, 377-389
Milani P, Gagliardi S, Cova E, Cereda C, ‘SOD1 Transcriptional and Posttranscriptional Regulation and Its Potential Implications in ALS’, Neurology Research International, 2011
Henry Gee, ‘Inside Lou Gehrig’s disease, Nature, 1999
Brian Owens, ‘Amyotrophic lateral sclerosis’, Nature 550, 2017