아주대 생물학실험1 A+ 생물정보학 보고서

소개글

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목차

1. 실험제목
2. 실험목적
3. 실험원리
4. 실험방법
5. 실험결과
6. 고찰
7. 참고문헌

본문내용

1. 실험제목
- 생물정보학

2. 실험목적
- 생물정보학 학문을 이해하고 생물정보학 Tool을 사용하는 방법을 익힌다.
- 생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조하고 어떤 서열인지 탐구한다.
- 생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 단백질 서열의 서열 유사성을 비교해본다.

3. 실험원리
1) 생물정보학
① 생물정보학 : 수학이나 통계학을 기초로 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 모든 분야를 포함하는 학문
② NCBI : 미국 국립 생물 공학 정보센터로 각종 생명공학 정보들을 담고 있으며, 이 모든 정보들은 검색엔진을 이용하여 온라인으로 열람할 수 있다. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)

2) DNA와 아미노산
① DNA : 뉴클레오타이드의 중합체로 당은 디옥시리보스를 가진다. 염기는 총 4개로 A,G,C,T를 가진다. 염기서열은 우리에게 큰 영향을 미친다. 이중나선이다.[1]
② 아미노산 : 단백질의 단량체로 아미노기, R기, 카복실기, C, H로 이루어져 있다. 아미노산의 서열에 따라 단백질의 종류가 결정된다.[2]
2) BLAST
① BLAST : 아미노산 서열이나 DNA 염기서열과 같은 생물학적 서열 정보를 비교하는 알고리즘으로 특정 서열을 데이터 베이스 서열과 비교, 동정 (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)
② BLAST 알고리즘 단계
- 1단계 : 쿼리를 특정 길이의 짧은 단어로 나누는 것이다.

- 2단계 : 생성된 단어와 일치하는 단어 검색한다.

- 3단계 : 양방향으로 일치하는 히트를 연장한다.

- 4단계 : 정렬 생성 및 통계량 계산한다.

참고 자료

TAYLOR 외/캠벨 생명과학 개념과 현상의 이해/라이프사이언스/제10판/2021/188-190쪽.
TAYLOR 외/캠벨 생명과학 개념과 현상의 이해/라이프사이언스/제10판/2021/47-48쪽.