"gromacs" 검색결과 1-6 / 6건

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  Molecular Dynamics Simulations of Phase Mixing and Demixing

  GROMACS를 이용한 시뮬레이션의 결과는 VMD라는 소프트웨어를 이미지화 되어 분자 단위로 시스템을 관찰할 수 있다. ... 본 실험에서는 GROMACS v. 4.5.4 라는 molecular simulation toolkit를 이용해 MD 시뮬레이션을 진행한다. ... 이것은 실제 실험이 아닌 시뮬레이션을 진행했기 때문이며, 조건을 정밀하게 조절한다면 오차를 제거 할 수 있다.[3] 2) GROMACS v. 4.5.4를 이용한 액체 혼합물의 시뮬레이션

  리포트 | 12페이지 | 3,000원 | 등록일 2020.04.28

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  MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION ppt

  Acetone 분자 400 개 물 분자 800 개 Methods Cyclohexane 분자 200 개 물 분자 800 개 GROMACS Results Discussion Water ... 분자의 구조 화학적 시스템의 분자 역학 Polar solvent - acetone Nonpolar solvent - cyclohexane 일정 크기 systembox Methods GROMACS

  리포트 | 24페이지 | 2,000원 | 등록일 2019.07.15

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  Molecular dynamics (MD) simulations : Conformational properties of polypeptides

  Experimental Methods 이 실험에서는 “GROMACS”라는 프로그램을 이용해서 분자 동력학을 연구할 것이다. ... 이 실험에서는 폴리알라닌과 폴리글라이신의 구조를 시스템화하고, 이들의 여러 물리량을 GROMACS를 이용해 시뮬레이션을 수행하고 분석해본다. ... Conclusion 이번 실험에서는 ‘GROMACS’라는 프로그램을 이용하여 폴리알라닌과 폴리글라이신의 구조를 분석하고 이 구조에 따른 여러 물리량을 계산하였다.

  리포트 | 12페이지 | 2,000원 | 등록일 2020.05.25 | 수정일 2020.12.20

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  분자 동역학을 이용한 구조 분석

  이때 L-J 파라미터와 전하값은 Electronic Supplementary Information(ESI) 값을 사용하고 이온들과 용매 분자들은 GROMACS 시뮬레이션 패키지를 사용하여

  리포트 | 6페이지 | 4,000원 | 등록일 2022.11.03

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  Molecular Dynamics Simulations of Phase Mixing and Demixing

  다음으로는 g_energy를 사용하는데 ener.edr 은 EM 중의 GROMACS의 모든 에너지 데이터들을 기록한 파일로서, g_energy를 이용하여 분석할 수 있다.

  리포트 | 15페이지 | 1,500원 | 등록일 2018.09.13 | 수정일 2022.02.21

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  MOLECULAR DYNAMICS(MD) SIMULATIONS

  GROMACS는 RMSD를 계산 할 수 있는 내장된 ‘g_rms’라는 utility가 존재한다. ... GROMACS는 가장 유명한 액체, 고체 그리고 생물학적 분자의 MD simulation을 위한 Open-source 프로그램 중 하나이다. ... Experimental method 이 실험해서 우리는 “GROMACS”라고 부르는 프로그램을 사용하여 MD simulation을 사용할 것이다.

  리포트 | 11페이지 | 3,000원 | 등록일 2016.06.30 | 수정일 2023.05.24

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